5月15日と16日、2人の男性がウガンダの首都カンパラの病院を訪れた。2人はいずれも最近コンゴ民主共和国から渡航してきたが、そのうちの1人は病院を出ることができなかった。
この2件の感染確認を受け、世界保健機関（WHO）は最高レベルの警戒態勢を発令した。5月17日、WHO事務局長のテドロス・アダノム・ゲブレイェスは、コンゴ民主共和国とウガンダで広がるエボラ出血熱の流行を「国際的に懸念される公衆衛生上の緊急事態」と宣言した。これはかつてCOVID-19や2014年の西アフリカにおけるエボラ危機に対して用いられた最高の指定である。
今回の株は「ブンディブギョ型」と呼ばれる珍しいウイルスで、2007年にウガンダ西部で初めて確認された。これまでに人類の歴史上わずか3回しか記録された流行がなく、承認されたワクチンも治療薬も存在しない。過去のコンゴのエボラ流行で使われたエルベボワクチンや抗体治療薬は、別の株向けに開発されたものであり、今回には効果が期待できない。
感染の中心地はコンゴ民主共和国北東部のイトゥリ州で、ウガンダや南スーダンと国境を接する紛争の多い地域だ。5月16日時点でWHOは検査で確認された感染者8人、疑い症例246人、死亡疑い80人を報告した。アフリカCDCの集計では疑い症例336人、死者87人にまで増加しており、少なくとも4人の医療従事者が含まれる。ブンディブギョ株の致死率は最大約50%に達するとされ、専門家の間で深刻な懸念が広がっている。
WHOはアフリカ地域事務局を通じてブニアへ約5トンの医療物資を空輸し、専門家チームを派遣している。国境封鎖は勧告されておらず、空港や主要な陸上国境での出国時検査が求められている。